No aclaraste en tu mensaje de cual manera insertaste el JCLIC en tu página web de sites.google.com, pero me imagino que lo habrás hecho agregándolo como "gadget", como está explicado en
éste página web.
Si lo insertás de esa forma, o sea como un IFRAME, el Jclic comienza solito apenas abrís la página web, pero si vos querés que no empiece hasta que el usuario haga un click, podés hacerlo de muchas formas, la más simple que se me ocurre es que en vez de agregarlo como "gadget" (o mejor dicho 'IFRAME') simplemente agregás un Link que diga:
"hacer click acá para que aparezca el JCLIC", y en el link ponés lo mismo que usaste anteriormente, o sea el link de tu archivo JCLIC zipeado con el siguiente agregado:
http://clic.xtec.cat/db/jclicApplet.jsp?project=....En la explicación escrita puede parecer complicado, pero realidad es simple, una pagina web vale más que mil palabras, hice un ejemplo de eso mismo en
ésta página web de sites.google.com.
Si querés podés poner una imagen fija con el primer pantallazo del JCLIC en cuestión, y el link se lo agregás a esa imagen.
En ese ejemplo que hice el JCLIC aparece en pantalla completa, pero si querés que aparezca como "gadget", o sea un IFRAME que ocupe un pedazo de tu pagina web, podés agregar una nueva página en tu sitio WEB y que esa página contenga un "gadget" como el que ya agregaste, y le ponés un link desde la página inicial, para se abra el jclic sólo cunado jagan click en el link