Yo actualicé el Ubuntu 10 al 12.04 en una MAgallanes MG2 (la de los Profesores, que viene con Ubuntu 10 y Windows XP, de mango celeste con disco de 160 Gb) y no hubo ningún problema. El nuevo Ubuntu anda bien y el Windows no fue tocado por la actualización.
Ni siquiera actualicé el Ubuntu 10 que venía. Me pedía que actualice un montón de cosas del Ubuntu 10 y en vez de eso simplemente le dí click al botón que decía "Actualizar a Ubuntu 12.04".
tardó como 3 o 4 horas. Primero se bajó alrededor de 1.4 Gb, y luego empezó a instalarse.
Lo malo es que todos los programas que estaban instalados se perdieron, incluido el theft deterrent. Acordate que sin el theft deterrent se te bloquea la Magallanes.
Eduardo Duarte explicó acá en el foro como instalar el Theft Deterrent en Ubuntu:viewtopic.php?f=27&t=1495De todas formas, ya que tenés también doble booteo podés usar el Theft deterrent que viene en Windows en caso de que no lo tengas en Ubuntu.
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Eso lo probé en una MG2 con Ubuntu+Windows, aunque tal vez vos tengas una MG1, las que tienen el Disco Duro de 120 Gb. No he hecho la prueba en una MG1, pero son casi iguales, y tienen casi lo mismo.
MG2:

- mg2.jpg (9.14 KiB) Visto 5644 veces
MG1:

- mg1.jpg (7.1 KiB) Visto 5644 veces
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En caso de que te dé problemas al actualizarse el Ubuntu, en el peor de los casos habría que flashearla nuevamente, eso te lo hace el Plan Ceibal, ya que la imagen que hay en el Portal Ceibal sirve sólo para las Magallanes que llevan solamente Ubuntu (sin Windows).
Si estás en Montevideo y te das una vuelta por el
Local del RAP de Malvín norte (Euskal Erría) podemos cargarle todo lo que venía cuando te la entregaron.